"Terwujudnya warga SMP Negeri 49 Jakarta berkarakter mulia, berprestasi, sadar lingkungan dan berwawasan global".

Dalam upaya mewujudkan visi tersebut, SMPN 49 Jakarta menetapkan misi sebagai berikut:

1. Membentuk lulusan yang beriman, bertakwa dan berakhlak mulia dengan mengembangkan sikap dan perilaku religius baik di dalam sekolah maupun di luar sekolah.
2. Mengembangkan budaya kewargaan, bernalar kritis, mandiri, kreatif, kolaborasi, kesehatan, komunikasi  dan berwawasan global.
3. Menyelenggarakan proses pembelajaran mendalam di sekolah.
4. Mewujudkan lingkungan belajar yang mendukung perkembangan sosial psikologis warga sekolah.
5. Mewujudkan Sekolah Ramah Anak dan inklusif.
6. Mewujudkan budaya literasi dan numerasi di era digital.
7. Melaksanakan 7 kebiasaan anak Indonesia hebat.